故事的主角机器人——东云名乃，一直憧憬成为一名普通的女生，却因为背上的发条而感到自卑，在被自称为博士的8岁萝莉胡乱改造之后，每次都无可奈何地感到自己与“普通女生”的距离越来越远了。除了萝莉博士外，故事还出现了很多非日常角色，如年龄为20岁且戴上博士制作的项圈能说话的黑猫、活泼且天然呆的吐槽女、擅长绘画的腐女、黑发眼镜女、外表看似不良少年实质很乖巧的男生、热爱麻糬的爆炸头男、被枪或火箭炮打到都不会死的演剧社社长等等。

以节能为座右铭的高中生折木奉太郎， 为一个小小的原因而加入了濒临废社的“古典文学部”。古典文学部的社员，包括他在社里认识的好奇宝宝，也就是女主角千反田爱瑠，还有他从国中就认识的伊原摩耶花和福部里志。这是他们四人以神山高中为舞台，对一桩桩事件展开推理的青春学园推理剧。“我很好奇！”奉太郎平静的灰色高中生活，因为千反田的这一句话而为之一变！

某个大陆的、某个时代。 大陆南北分割的战争结束了，世界逐渐走向了和平。 在战争中、作为军人而战斗的薇尔莉特·伊芙加登离开了军队，来到了大港口城市。怀抱着战场上一个对她而言比谁都重要的人告诉了她“某个话语”――。 街道上人群踊跃，有轨电车在排列着煤气灯的马路上穿梭着。薇尔莉特在街道上找到了“代写书信”的工作。那是根据委托人的想法来组织出相应语言的工作。 她直面着委托人、触碰着委托人内心深处的坦率感情。与此同时，薇尔莉特在记录书信时，那一天所告知的那句话的意思也逐渐接近了。

时已入春，已经进入高中三年级的北白川玉子仍然总是想着打糕的事情。 春天傍晚的放学路上，玉子好友四人组谈论着关于将来出路的事情。大家虽然对此感到不安，但似乎对将来的事情都有好好地考虑过。玉子也无意中说出自己将来想要继承家业。 同时，住在玉子家的对面、一直和她在一起的饼藏，也下定了某种决心。 周围的各种事物都在逐渐改变着，一点一点地动摇着玉子的心。

　　座落某个小镇的兔子商店街上，有一间日式饼店，住着一位十分喜欢饼类小吃的高中一年级女生——玉子。除了偶尔在店铺协助父亲，以及钻研新口味的饼类小吃外，她亦有跟学校的朋友参与羽毛球部活动。而饼店对面是同行的竞争对手，两边的父亲经常都因生意问题而喧哗。不过对方儿子——饼藏却自小跟玉子建立青梅竹马的关系，近日更不断隐约地表达心思，只是玉子没有特别注意，更常常被旁观的朋友拿出来扰攘一番。总而言之，玉子就是在商店街众人的护荫下，如此热闹地渡过每一天，生活可谓过得相当快乐。 　　除夕，也就是玉子的生日，处于商店街年末最繁忙的时刻。庆祝仪式已经成为了商店街上下的惯例，唯独今年的饼藏没有准时来到。直到他带着礼物来到之时……一只光辉灿烂的鸟出现在众人面前。偶然变得越来越热闹的兔子商店街，亦正式开始其稍微不同的新一年。

以前的人们生活在海中的世界，能够在大海中呼吸并且生活。然而不久之后憧憬陆地的人们抛弃了大海，舍弃了海神所赐予的羽衣。人类逐渐分成在海中生活的人类以及在陆上生活的人类，原本同样相互交流的人们，随着时间流逝，想法也不相同了。 在海中生活的四名少年少女——先岛光、向井户爱花、比良平千咲、伊佐木要。他们因海村汐鹿生的波路中学被废校而转学到陆地上的美滨中学，并在那里遇到了在陆地上出生的少年——木原纺，他们由此相会。

某日在雾弥湖的上空中出现了谜样的圆盘，一度造成全世界的混乱与恐慌，但飞碟却只停留在空中，并没有进一步的行动。在时间流逝中人们渐渐对这件事失去了兴趣......就在两名少女相遇后，静止的时间再次流动，让众人有所改变的全新故事展开，中学生活最后那一年，将拥有一生无法忘怀的回忆。

非常喜欢给女生剪头发的初中生少年灰村切，某天放学回家时走进一栋西式建筑里，在那里他遇到了有着一头美丽的黑色长发少女武者小路祝。小祝的头发由于受到了诅咒，所以自出生以来不管用什么方法都无法剪断。然而，灰村切使用了自己当作护身符随身携带的剪刀成功剪断了小祝的头发。自此，身份是“发之女王”后代的少女与即使身为携带“杀害遗物”的杀人魔子孙但还是想守护这位少女的爱与战斗的故事开始了！